人防地下室和普通地下室在工程的设计上不同。普通地下室只需要按照该地下室的使用功能和荷载进行设计就可以了，它可以全埋或半埋于地下。而防空地下室除了考虑平时使用外，还必须按照战时标准进行设计，因此，人防地下室只能是全部埋于地下。由于战时工程所承受的荷载较大，人防地下室的顶板厚度、墙体厚度、埋深等都有不同要求，顶板、外墙、底板、柱子和梁都要比普通地下室的尺寸大。有些为了满足平时的使用功能需要，还需要进行临战前转换设计，例如战时封堵墙、洞口、临战加柱等。此外，对重要的人防工程，还必须在顶板上设置水平遮弹层以抵挡炸弹的袭击。